Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Odf2A3KGV1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms