Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rnf39A2RT81 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rnf39A2RT81 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rnf39A2RT81 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rnf39A2RT81 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rnf39A2RT81 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rnf39A2RT81 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf39A2RT81 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms