Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Scn3aA2ASI5 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Scn3aA2ASI5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms