Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Syndig1A2ANU3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms