Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac6Q9Z2V5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdac6Q9Z2V5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms