Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt16Q9Z2K1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt16Q9Z2K1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms