Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptgdr2Q9Z2J6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptgdr2Q9Z2J6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms