Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uso1Q9Z1Z0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms