Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lgr5Q9Z1P4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lgr5Q9Z1P4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms