Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx39bQ9Z1N5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx39bQ9Z1N5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms