Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1K5

Arih1, E3 ubiquitin-protein ligase ARIH1, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arih1Q9Z1K5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arih1Q9Z1K5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arih1Q9Z1K5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arih1Q9Z1K5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arih1Q9Z1K5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arih1Q9Z1K5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms