Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Katna1Q9WV86 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Katna1Q9WV86 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Katna1Q9WV86 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katna1Q9WV86 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms