Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnip1Q9WUU8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnip1Q9WUU8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnip1Q9WUU8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms