Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn3Q9WUK7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn3Q9WUK7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms