Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptpn4Q9WU22 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn4Q9WU22 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptpn4Q9WU22 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptpn4Q9WU22 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptpn4Q9WU22 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptpn4Q9WU22 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn4Q9WU22 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn4Q9WU22 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn4Q9WU22 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn4Q9WU22 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn4Q9WU22 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn4Q9WU22 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms