Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nrf1Q9WU00 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nrf1Q9WU00 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nrf1Q9WU00 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nrf1Q9WU00 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nrf1Q9WU00 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nrf1Q9WU00 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nrf1Q9WU00 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nrf1Q9WU00 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nrf1Q9WU00 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nrf1Q9WU00 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nrf1Q9WU00 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nrf1Q9WU00 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nrf1Q9WU00 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nrf1Q9WU00 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nrf1Q9WU00 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nrf1Q9WU00 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms