Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul1Q9WTX6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms