Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ggps1Q9WTN0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggps1Q9WTN0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms