Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trex2Q9R1A9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trex2Q9R1A9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms