Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc26a4Q9R155 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc26a4Q9R155 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms