Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0X0

Med20, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med20Q9R0X0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med20Q9R0X0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms