Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Lamc3Q9R0B6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Lamc3Q9R0B6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Lamc3Q9R0B6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms