Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clic4Q9QYB1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clic4Q9QYB1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clic4Q9QYB1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clic4Q9QYB1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clic4Q9QYB1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clic4Q9QYB1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms