Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Opn4Q9QXZ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms