Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cbx8Q9QXV1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms