Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf354bQ9QXT9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf354bQ9QXT9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf354bQ9QXT9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf354bQ9QXT9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf354bQ9QXT9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf354bQ9QXT9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf354bQ9QXT9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf354bQ9QXT9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf354bQ9QXT9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf354bQ9QXT9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf354bQ9QXT9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf354bQ9QXT9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf354bQ9QXT9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf354bQ9QXT9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf354bQ9QXT9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf354bQ9QXT9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf354bQ9QXT9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms