Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Apbb1Q9QXJ1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apbb1Q9QXJ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Apbb1Q9QXJ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Apbb1Q9QXJ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Apbb1Q9QXJ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Apbb1Q9QXJ1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apbb1Q9QXJ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apbb1Q9QXJ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apbb1Q9QXJ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apbb1Q9QXJ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apbb1Q9QXJ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apbb1Q9QXJ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apbb1Q9QXJ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apbb1Q9QXJ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apbb1Q9QXJ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apbb1Q9QXJ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apbb1Q9QXJ1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms