Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Limd1Q9QXD8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Limd1Q9QXD8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms