Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PdcQ9QW08 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdcQ9QW08 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdcQ9QW08 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms