Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdgfl3Q9JMG7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms