Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkain4Q9JMG4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkain4Q9JMG4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain4Q9JMG4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms