Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnaja4Q9JMC3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnaja4Q9JMC3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms