Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LitafQ9JLJ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LitafQ9JLJ0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LitafQ9JLJ0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LitafQ9JLJ0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LitafQ9JLJ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LitafQ9JLJ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LitafQ9JLJ0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LitafQ9JLJ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LitafQ9JLJ0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LitafQ9JLJ0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LitafQ9JLJ0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LitafQ9JLJ0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LitafQ9JLJ0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LitafQ9JLJ0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LitafQ9JLJ0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms