Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfx5Q9JL61 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rfx5Q9JL61 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx5Q9JL61 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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