Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gde1Q9JL56 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gde1Q9JL56 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gde1Q9JL56 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms