Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnq4Q9JK97 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnq4Q9JK97 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms