Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga3Q9JJZ8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga3Q9JJZ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga3Q9JJZ8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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