Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nrip3Q9JJR9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip3Q9JJR9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms