Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco4Q9JIS3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco4Q9JIS3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms