Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS9

Cwc15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc15Q9JHS9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc15Q9JHS9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc15Q9JHS9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc15Q9JHS9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc15Q9JHS9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc15Q9JHS9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc15Q9JHS9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc15Q9JHS9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc15Q9JHS9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cwc15Q9JHS9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc15Q9JHS9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms