Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Rb1cc1Q9ESK9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Rb1cc1Q9ESK9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rb1cc1Q9ESK9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Rb1cc1Q9ESK9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Rb1cc1Q9ESK9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Rb1cc1Q9ESK9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Rb1cc1Q9ESK9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Rb1cc1Q9ESK9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rb1cc1Q9ESK9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rb1cc1Q9ESK9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms