Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem27Q9ESG4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem27Q9ESG4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem27Q9ESG4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem27Q9ESG4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem27Q9ESG4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem27Q9ESG4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem27Q9ESG4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem27Q9ESG4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem27Q9ESG4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem27Q9ESG4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem27Q9ESG4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms