Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cse1lQ9ERK4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms