Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dap3Q9ER88 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dap3Q9ER88 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dap3Q9ER88 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms