Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Clstn2Q9ER65 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Clstn2Q9ER65 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clstn2Q9ER65 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms