Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3bpQ9EQG9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a3bpQ9EQG9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms