Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1lQ9EQ00 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1lQ9EQ00 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms