Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgap1Q9EPJ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms