Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufs3Q9DCT2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufs3Q9DCT2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms