Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap3s1Q9DCR2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3s1Q9DCR2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap3s1Q9DCR2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms